建築家に依頼すると保証面で心配なのですが？

保証は工事を行う工務店が保証することになります。
住宅瑕疵担保履行法という法律が施行されてから、新築の住宅はどこに依頼しても「構造耐力上主要な部分および雨水の浸入を防止する部分」については10年保証が受けられるようになりました。
万が一、事業者が倒産した場合等でも、2000万円までの補修費用の支払いが保険法人から受けられます。