民泊が禁止されたら、建物自体が使えなくなるのですか？

いいえ。住宅宿泊事業法（民泊新法）による民泊は建築基準法上「住宅」として扱われているため、民泊ができなくなっても、建物自体が使えなくなるわけではありません。普通の住宅として使う分には、用途変更の手続きも基本的に不要です。